有许多观察表明，一种细胞或组织类型具有与另一种不同的 DNA 甲基化模式，但甲基化途径如何被调节以最终在不同组织中产生不同的结果仍然知之甚少，”资深作者、副研究员 Julie Law 说。索尔克植物分子和细胞生物学实验室教授。“我们发现，在给定组织中表达的CLSY是控制核心 DNA 甲基化机制如何针对不同组织中不同基因组位置的机制。”

DNA甲基化的研究属于表观遗传学领域——在不改变DNA序列本身的情况下改变DNA功能的分子修饰。这既是一个必要的过程，也是一个危险的过程。例如，它有助于在发育中的胚胎中建立细胞身份，但可能会在以后的生活中引发癌症。在植物中，DNA 甲基化缺陷会导致发育缺陷并对作物产量产生负面影响。

DNA甲基化受许多因素调节，包括某些类型的小RNA。Salk 团队与模式植物拟南芥合作，发现 CLASSY 基因家族 ( CLSY 1-4) 根据组织在不同位置起作用，揭示了植物发育过程中甲基化模式是如何产生的。

目前的工作扩展了 Law 和她的团队之前的一项研究，他们发现在拟南芥中，CLSY基因通过小 RNA 决定了基因组中的哪些位点被甲基化。目前的研究解决了这个过程是否会导致不同拟南芥组织(叶、花蕾、胚珠和莲座)中不同甲基化模式的更大问题。

研究人员发现，CLSY基因的表达因植物组织类型而异。例如，所有四个CLSY基因都在花蕾中表达，而CLSY3在胚珠中强烈表达，CLSY1在叶和莲座组织中表达。